SpatialX 是一个专为空间数据的多图像和多技术分析而设计的集成平台。与 BioTuring Lens 类似,SpatialX 支持各种技术的分析,例如 CosMx、Xenium、Visium 等。通过优化计算和更新的数据库来支持细胞注释,SpatialX 提供了大量工具和算法来分析空间环境中的数据。
在直观的平台上分析空间转录组学数据
SpatialX支持图像的并排可视化,使用户能够流畅地比较样本
在一个项目中跨多种空间技术进行集成分析。SpatialX目前支持:
Nanostring CosMx(Version 1 and Version 2)
Vizgen MERSCOPE(Version 1 and Version 2)
10x Genomics Xenium(Xenium H&E)
10x Genomics Visium (Cytassist)
10x Genomics Visium HD
ZARR 或 Squidpy 格式的自定义数据集
(待定)单细胞空间蛋白质组学
SpatialX目前提供3种统计分析方法:Venice、T-test、Wilcoxon Rank-Sum Test。
空间数据的区域分割可识别空间上不同的区域,这有助于我们了解这些区域背后的生物过程。
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